Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf4Q9QZS2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf4Q9QZS2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms