Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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