Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms