Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms