Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PolkQ9QUG2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PolkQ9QUG2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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