Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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