Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms