Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms