Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpr88Q9EPB7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms