Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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