Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms