Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pop7Q9DCH2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop7Q9DCH2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms