Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnf6Q9DBU5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnf6Q9DBU5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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