Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms