Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms