Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms