Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc7Q9D541 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ccdc7Q9D541 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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