Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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