Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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