Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap53Q9D439 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap53Q9D439 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms