Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms