Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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