Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms