Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms