Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mis12Q9CY25 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms