Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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