Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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