Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms