Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ykt6Q9CQW1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms