Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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