Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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