Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q9CQC3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q9CQC3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQC3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQC3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQC3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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