Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms