Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nus1Q99LJ8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms