Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms