Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms