Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms