Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lims1Q99JW4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lims1Q99JW4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms