Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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