Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms