Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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