Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Cldn16Q925N4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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