Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp3Q91W36 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp3Q91W36 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp3Q91W36 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp3Q91W36 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp3Q91W36 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp3Q91W36 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp3Q91W36 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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