Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms