Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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