Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgtbQ8VD33 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgtbQ8VD33 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms