Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Dnajc28Q8VCE1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dnajc28Q8VCE1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dnajc28Q8VCE1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dnajc28Q8VCE1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Dnajc28Q8VCE1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dnajc28Q8VCE1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Dnajc28Q8VCE1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Dnajc28Q8VCE1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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