Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GcaQ8VC88 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms