Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rasgef1bQ8JZL7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rasgef1bQ8JZL7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rasgef1bQ8JZL7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rasgef1bQ8JZL7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rasgef1bQ8JZL7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rasgef1bQ8JZL7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rasgef1bQ8JZL7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rasgef1bQ8JZL7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rasgef1bQ8JZL7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms