Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf1Q8CFK2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms